Колір - найочевидніша і привабливіша особливість коштовних каменів. Колір будь-якого матеріалу відбувається безпосередньо із-за природи світла. Денне світло, часто зване білим світом, є фактично сумішшю різних квітів. Коли світло проходить через матеріал, частина кольору може бути поглинена, тоді як інші проходять. Частина світу, яка не поглинається, доходить до наших очей, як білий світ мінус поглинені кольори. Рубін здається червоним, тому що він поглинає всі інші кольори білого світу - синій, жовтий, зелений, і т.д. - окрім червоного.
Один і той же камінь може показувати різні кольори. Наприклад, рубін і сапфір мають той же самий хімічний склад (обидва вони корунд), але показують різні кольори. Навіть той же самий коштовний камінь може представляти багато різних квітів: сапфіри показують різні відтінки синього і рожевого кольору, а "декоративні сапфіри" показують цілий діапазон інших квітів від жовтого до оранжево-рожевого, останній називається "Сапфір Падпарадша".